Haplogrupperna är knutna till de raka linjerna i släktträdet och det beror på hur det DNA man testar har förts vidare från en generation till en annan. Det ”vanliga” DNA, som skapar de individer vi är, är som bekant en blandning av två föräldrars bidrag. Om man betänker att detta egna DNA späds ut med lika mycket okänt DNA för varje generation bakåt i tiden man går, inser man att det snart inte finns mycket likhet mellan avlägsna anors arvsanlag och det egna DNAt.

Som tur är finns det DNA som inte utsätts för denna sammanblandning och därför bibehåller sitt utseende. Sådant DNA finns det två varianter av som används inom DNA-genealogin:

• Den till det raka fädernet knutna varianten, Y-DNA, som ärvs från far till son via den manliga Y-kromosomen
• Raka mödernets variant, mtDNA (mitokondriellt DNA), som ärvs från mor till barn.

Detta innebär att en man kan genom att testa sitt eget DNA kan identifiera haplogruppstillhörighet för alla sina anor på det raka fädernet och det raka mödernet och en kvinna kan göra detsamma för sitt raka möderne. Skillnaden beror på att både män och kvinnor ärver mtDNA (men det är bara kvinnan som kan föra det vidare) medan kvinnor aldrig ärver något från den manliga Y-kromosomen.

Vill en kvinna ta reda på haplogrupptillhörigheten på hennes fars sida måste det till ytterligare ett test med prov taget ifrån just fadern och om inte det är möjligt t ex en farbror, farfar, bror eller en brorson. Detta innebär även att när man som kvinna överväger att göra ett sånt här test och enbart är intresserad av den information som rör den genealogiska biten kan det vara mer lönsamt att skicka in prov från en broder istället.

Haplogruppstillhörigheten är som tidigare nämnts densamma för alla personer av samma kön i raka led. Detta innebär att med en man som exempel så är alla andra raka manslinjer som utgår ifrån någon av männen i testpersonens raka fäderne av samma haplogrupp som den testade personen.

Därför kan ett test definiera haplogruppstillhörighet för ett ganska stort antal personer om man har en stamtavla med många grenar och med start många generationer bakåt i tiden.